多伦多大学拥有三所分校。每所分校在经费，内部事务，招生等方面相对独立。1827年，约翰·斯特拉坎(John Strachan)获得了英王乔治四世(King George IV)在上加拿大(Upper Canada)成立国王学院(King's College)的皇家特许，这一学院便是多伦多大学圣乔治校区(St. George)的前身。作为多大的发源地及主校区，它与安大略省政府及议会分散在市中心的女皇公园四周，现下设十一所学院。通常所指的多伦多大学即该校区。士嘉堡分校(Scarborough Campus)位于多伦多东北方向，始于1964年，距主校区约三十公里，占地共三百英亩。另一校区密西索加分校(Mississauga Campus)位于多伦多西三十三公里的密西索加市，于1967年正式启用。
