广大学子常申请的专业有： 言语类、社会学、教育类、文学文化类、哲学、伦理、政治国际关系等。此类专业可以接受转专业学生申请，为不想本专业申请学生提供了成功转型的可能。
开设院校： 东京大学、京都大学、大阪大学、茶水女子大学、东京外国语大学、东京学艺大学等绝大多数的院校。当然很多私立院校也是非常好的选择，如庆应义塾、早稻田、上智大学等。
申请要求： 日语一级、托福或者托业
工学系统：约有220个学科。
由于日本科学技术发展的比较快，很多赴日留学的学生希望能够学到更前言的科技知识。
申请专业集中在： 计算机、机械工程、电子电器工程、能源系统、建筑等几大方向。
常申请院校： 东京大学、京都大学、东京工业大学、名古屋工业大学等。
申请要求： 日语二级及以上成绩、托福或者托业成绩
理学系统：约有340个学科。
常申请的专业除了生物、化学、物理、农业等常规专业外，随着现在人对于生活质量的提高，食品科学也成为了广大学子偏爱的专业。
开设院校： 北海道大学、东京农工大学、东京海洋大学等。
申请要求： 日语二级及以上水平、托福或者托业
医疗、看护系统：约有55个学科。
日本是为数不多可以接受临床医学外国留学生申请的国家，此制度为想出国深造的学生提供了便捷之路。除临床医学之外，社会医学及看护医学也吸引了越拉越多的学生申请。
开设院校： 大阪大学、冈山大学、金泽大学、德岛大学、东京医科齿科大学等。
申请要求： 18年受教育背景、日语二级及以上水品、托福或者托业成绩。
艺术系统：约有80个学科。
日本动漫伴随一代又一代人的成长，而动漫产业在国际上的发展也是举足轻重。很多学生选择去日本学习动漫、大学院的教育为学生提供了良好的发展平台。还有工业设计、平面设计、音乐、美术等艺术类专业也成为了近年来热门申请专业。
开设院校： 东京艺术大学、九州大学、千叶大学、筑波大学、京都工艺纤维大学、神户工科大学、多摩美术大学、武藏野美术大学等。
申请要求： 作品集、日语二级
