据香港明报报道，在新高中学制下，香港教育局鼓励学生文理并重，在7.8万名首届文凭试考生中，修读传统“生物、化学、物理”的纯理学生减至5538人，另有1.1万人选修课程减半的“组合科学”或“综合科学”科。但媒体发现，部分海外名牌大学的部分理科和医科课程，不承认“组科”属理科资历，令部分理科生被拒升学，海外留学梦恐难圆。
香港教育局回应说，一般而言学校在中三向家长及学生介绍学校的选科政策，并进行选科调查，然后因应实际情况为学生提供合适的科目选择。发言人续称，海外院校订定文凭试收生要求时，不同学科或按课程水平、评核要求、订定成绩等级的标准，有不同的收生要求。
现时考评局网页列出35间英美等地已承认香港中学文凭试的大学，包括美国耶鲁大学、英国剑桥大学等名校的收生要求，部分学校个别学科却不承认文凭试的组合科学和综合科学。例如剑桥大学医科要求学生从化学、生物、物理和数学4科中选修3科，邓迪大学(留学群 liuxuequn.com)医科要求学生修读化学、生物以及另一选修科。
有部分本地名校学生因学校修课安排，无法攻读“物理、化学、生物”科，只能读一个理科另加组合科学，但向英国多所大学查询时，却发现组合科学不获承认，出现不能衔接问题。
媒体曾尝试向上述大学查询，其中英国邓迪大学在港收生代表、麦理觉教育服务经理戴志晖表示，该校承认文凭试，但医科不接受学生以组合科学或综合科学，取代生物和化学科。至于其它学科则视个别课程而定，若课程要求学生修读数学，学生必须修读延伸部分。
他补充，若学生只修读一科理科，可考虑申请报读该校为期1年的医科基础课程，先修读生物、化学等基础知识，再衔接该校5年的医科本科。
戴志晖建议，学生可考虑在中五时前往英国升读第11班，透过高考或基础班升读大学。他透露，不少英国和澳洲大学也向他反映，“即使接受文凭试成绩，也不是所有课程也接受组合科学和综合科学”，建议有意日后出国升读理科课程的学生，宜选报生物、化学、物理等传统理科课程。
