南洋商学院是新加坡唯一及亚洲第三所同时获得欧洲质量发展体系(EQUIS or European Quality Improvement System)及美国国际管理教育联合会(AACSB or Association to Advance Collegiate Schools of Business)两项认证的商学院。南洋商学院名列全球前50强之列，是新加坡最好的商学院，亚洲最佳商学院前三名。南洋商学院开设的会计学、商学、MBA、EMBA、金融工程、金融学等本科和研究生课程受到国际学术界和企业界的极大认可。
黄金辉传播与信息学院为亚洲最知名的传播教育与研究学府之一。
文学院愿景是成为亚洲主要的人文与社会科学学术中心。
工学院共有1万5千名学生。南大的工程学院在宇宙航天，机器人研究方面取得重大进展，分别发射了自主研发的卫星并研发了仿人形机器人(代号：NASH)，令世界瞩目。
南洋理工大学孔子学院是为了更好的利用南大在中华语言和文化方面的专家人才和丰富资源，南大于2005年与中国国家对外汉语教学领导小组办公室联合设立了南洋理工大学孔子学院。在中国国家汉办与山东大学国际教育学院的鼎力支持下。
康奈尔-南洋款待管理学院为满足硕士生的需求变更，以及切合款待业的全球化趋势，久享盛誉的美国康奈尔大学酒店管理学院与在亚洲开办杰出商务课程的南洋理工大学商学院携手合作。
南洋科技创业中心于2001年由南大和新加坡国家经济发展局联合创办，素有南大“小硅谷”之称，秉承了南洋大学的创业与创新精神，是以科技创新为先导的研究型教学机构，拥有一流的教学设施; 南大在政府以及海内外学术和企业界的广泛联系和人脉，使南洋科技创业中心在办学资源方面有着得天独厚的优势，毕业生能获得美国硅谷多数大型企业的认可以及着名风险投资公司的关注。
拉惹勒南国际研究院(RSIS)在亚洲地区一千多个智囊库中脱颖而出，排名亚洲第三位。拉惹勒南国际研究院是一所以亚太地区的安全和稳定为研究重点的研究生院，在一次广泛的全球性智库评选中荣获亚洲第三名的荣衔。全球性“通往智囊库之路”排名活动是美国宾夕法尼亚大学智库与公民社会组织计划部所进行的一部分研究内容，对全世界的智囊库进行调查和排名。这项研究需要对候选者经过诸多领域的专家评委会的审核，包括从事智囊库研究的国际知名学者、学术主管、智囊库研究员、公私部门赞助人、决策者等。
李光前医学院是于2010年南洋理工大学新设立的学院，合作方是在世界上享有盛誉的伦敦帝国学院。于2011年卸任的南大前任校长徐冠林，还设立了三个新学院(数理科学学院、人文与社会科学学院和艺术、设计与媒体学院)，以及两所卓越研究中心(新加坡地球观测与研究所和新加坡环境生物工程中心)。据报道李光前医学院将于2013年开始招生，而李光前医学院也将成为新加坡国内继新加坡国立大学杨璐玲医学院之后第二所公立大学开办的医学院，将为新加坡以及世界培养更多的医学专才。
诺贝尔化学委员会主席(1997在任)，着名的植物化学研究者，南大的现任校长贝蒂尔·安德森教授。南大下一个令人振奋的发展项目是跟伦敦帝国理工学院合作设立的新医学院，这将为新加坡的医学教育和研究带来新局面。”
